다 아시는 얘긴지는 모르겠는데...
없어서 올립니다.

1. 클래스 이름을 찾는다.
HWND hWnd = ::FindWindow("IEFrame", NULL);
if (hWnd == NULL)
{
    ShowMessage("Can't find window");
    return;
}

HRGN hRgn = ::CreateRectRgn(0, 0, 0, 0);
int i = ::SetWindowRgn(hWnd, hRgn, TRUE);

위와 같이 해주면 화면상에 실해되고 있는 인터넷익스플로러가 없어집니다.
실제로 없어지는것은 아니고 사이즈가 0이 되는 것이지요.

2. 캡션이름으로 찾는다.
HWND hWnd = ::FindWindow(NULL, "계산기");
if (hWnd == NULL)
{
    ShowMessage("Can't find window");
    return;
}

HRGN hRgn = ::CreateRectRgn(0, 0, 0, 0);
int i = ::SetWindowRgn(hWnd, hRgn, TRUE);

1과 2의 방법이 있으나 1의 방법이 더 낮지 않을까 생각합니다.
캡션은 언제든지 변하니까 ...

클래스 이름이나 캡션을 알아내는 방법을 모르겠다구요?
MS Developer Studio내의 "Microsoft Visual Studio 6.0 도구들"메뉴에
"Spy++"이라는 프로그램을 실해시키면 이같은 정보들을 다 찾을 수 있습니다.

다른 프로그램을 자기가 원하는 윈도우 모양을 만들수 있겠죠?