권한 문제일 겁니다. ISAPI는 기본적으로 IIS가 관리하는 인터넷 게스트 계정으로 실행됩니다.
인터넷 게스트 계정은 'IUSER_컴퓨터이름'이라는 이름으로 만들어진 계정으로, 이름 그대로 게스트 계정이기 때문에, 일반적인 서버 로컬 파일들을 실행할 권한이 없습니다.
아마 해당 실행파일의 등록정보 페이지를 열어서 실행 권한에 'IUSER_컴퓨터이름' 계정을 추가해주면 될 겁니다.

그런데 뭣때문에 ISAPI에서 로컬 파일을 실행하려고 하시는지요.
좀 위험한 시도일 수 있는데...


빌더초보 님이 쓰신 글 :
: 안녕하세요.
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: 제목 그대로 isapi 로 프로젝트를 진행 중입니다.
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: web 에서 isapi 로 제작된  bbb.dll (isapi 모듈)로 요청이 들어오면 서버내에 특정 a.exe 파일을 실행할려고 합니다.
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: shellexecute, winexec, createprocess 등을 사용해 보았지만, exe 파일이 실행이 안되네요.
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: 답변을 달아주세요. ^^