제가 알기로는 메인 폼을 최소화 한다고 해서 다른 폼이 사라지는 일은 없는데요...
혹시 메인폼의 OnDeactivate 핸들러 등에 다른 폼과 관련된 코드가 있는 것은 아닌지 잘 살펴보시기 바랍니다.
만약 말씀하신 내용에서 서브 폼이라는 것의 Parent가 메인폼이라면 메인 폼을 감추기 전에 서브 폼의 Parent를 NULL로 설정하면 될 것인데 그 것은 아닌 것같고...
하여튼 메인 폼의 코드에서 서브 폼을 참조하는 부분을 모조리 찾아 보면 해답이 쉽게 나올 것 같습니다.

오진욱 님이 쓰신 글 :
: 두개의 폼이 있습니다...
: 메인폼과 서브폼...
: 메인폼을 최소화 시키게 되면 서브 폼도 같이 사라집니다...
:
: 메인폼이 최소화 되더라도 여전히 서브폼을 보이게 하는 방법이 있을까요...
: 그럼...답변 기다리겠습니다...