직접 구현하는 파일DB가 아니라면 크게 고민할 문제가 아닌것 같습니다.
구조는 여러가지가 있겠지만 그냥 생각나는 2가지를 적어보자면..
1. [그룹이름 목록] [사용자 목록-그룹ID포함]
2. [그룹1-사용자목록][그룹2-사용자목록]
이런식이겠지요 -_-
공개소스 같은걸 찾아보시면 도움이 될것 같습니다.