함수 내부에서 할당해 봤자 함수 내부에서만 boardctrls에 할당된 값들이 저장되는것입니다.
boolean init(BoardCtrls** boardctrls)
{
   int boardcnt = 4;
   *boardctrls = (BoardCtrls *)malloc(((boardcnt*4) + 1) * sizeof(BoardCtrls));
   if( boardctrls == NULL ) return false;
   .
   .
}

--> 쓰는데에서는 Init(&boardctrls);

요렇게 바꾸셔서 사용하시져...