음... 정확한 내용 파악은 않되지만, 제가 해석하기론..
1번째 프로그램이 돌아가고~
2번째 프로그램을 돌리는데, 2번째 프로그램에서 작업이 완료되면~
1번째 프로그램에 신호를 보낸다.. 

그럼, 1번째 프로그램에서 메시지신호를 받아낼, message루프가 있어야 하겠네요.
따라서, Message map을 사용해서 적절한 Message를 잡아오고,

2번째 프로그램에서는 1번재 프로그램의 Handle을 가져와서,
SendMessage를 보내줘야 겠네요.

제가 생각하기에는 직빵으로 마우스 이벤트를 보내기 보다는  User Message
를 보내서 처리하심이 어떨지요?
즉, 이벤트핸들러에 동작하는 함수를 따로 만들고, 마우스와 User Message Handler에
걸어주는 거죠.

아니면, 죄송~


아담 님이 쓰신 글 :
: 이미실행중인 프로그램에  나중에 실행된 프로그램이
:
: 왼쪽 마우스나, 오른쪽 마우스 메세지를 보내야 하는데
:
: 이미실행중인 프로그램의 윈도의 핸들을 가져와서
: SendMessage, PostMessage등을 해봐도 메세지 전달이 안되는데
: 아시는분의 도움을 바랍니다..
:
: 즐거운 하루 되시길...